RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SYS1Q8N2H4 156 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 BCORP1Q8N888 145 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 C3orf49Q96BT1 292 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MAP6Q96JE9 813 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DDOQ99489 341 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 KCNK15Q9H427 330 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DLL4Q9NR61 685 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SPTBP11277 2137 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 A0A087WUJ7 227 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SERINC4A6NH21 518 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 IFITM5A6NNB3 132 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF879B4DU55 563 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 H0YC42 278 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 WISP1O95388 367 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TPOP07202 933 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CT45A8P0DMV1 189 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CT45A9P0DMV2 189 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DNASE1P24855 282 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MAOBP27338 520 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DPP4P27487 766 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DCTDP32321 178 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HYAL1Q12794 435 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF550Q7Z398 422 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PRR22Q8IZ63 422 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DGAT2Q96PD7 388 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 POLE3Q9NRF9 147 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CA10Q9NS85 328 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LAMA1P25391 3075 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LRP4O75096 1905 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR5K3A6NET4 321 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 A8MUA0 341 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RAD1O60671 282 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TNFP01375 233 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 IFNA16P05015 189 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ADRA2CP18825 462 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 AKT2P31751 481 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PTH2RP49190 550 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GPR143P51810 404 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HHEXQ03014 270 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LTBQ06643 244 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LGALS3BPQ08380 585 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ANGPT1Q15389 498 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF141Q15928 474 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HACD4Q5VWC8 232 aa6.63□□□□□ -1.35
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