RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENKD1Q9H0I2 346 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 INIPQ9NRY2 104 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R5Q9NYW4 299 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPRR3Q9UBC9 169 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 FREM3P0C091 2139 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CACNA1GO43497 2377 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GVC2 190 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 AQP7O14520 342 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXCL13O43927 109 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPAN19P0C672 248 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDN15P56746 228 aa24.59■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MYBPC1Q00872 1141 aa24.59■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KLRB1Q12918 225 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF691Q5VV52 312 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM225Q6GV28 225 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT80Q6KB66 452 aa24.59■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM99Q8N816 258 aa24.59■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRG7Q96K78 797 aa24.59■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MCIDASD6RGH6 385 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVH48-1M5A8F1 160 aa24.58■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MYF6P23409 242 aa24.58■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ACSM5Q6NUN0 579 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa24.58■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 Q8NA96 180 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4Q3Q8NH05 313 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAMK2AQ9UQM7 478 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 AQP7P3A6NL99 342 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 E9PQ18 207 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD14P08571 375 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPN1P15169 458 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRK5P34947 590 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNAPC1Q16533 368 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 C12orf73Q69YU5 71 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 LNX2Q8N448 690 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 KATNB1Q9BVA0 655 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLSCR2Q9NRY7 297 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRCH1Q9Y2L9 728 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PRG6 482 aa24.56■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SYNGR4O95473 234 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVK-25P63136 954 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRTCAP3Q53RY4 240 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 THAP5Q7Z6K1 395 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKK1Q8NFD2 765 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR137Q96N19 417 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa24.56■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASD1Q9Y272 281 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A18H0YCH9 400 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 IDH3BO43837 385 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A18Q3C1V0 323 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTCHD4Q6ZW05 846 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPAT4Q86UL3 456 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 PM20D2Q8IYS1 436 aa24.56■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NRIP3Q9NQ35 241 aa24.56■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MED12Q93074 2177 aa24.55■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PNV4 684 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPZL2O60487 215 aa24.55■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 H3F3AP84243 136 aa24.55■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 PXKQ7Z7A4 578 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 UEVLDQ8IX04 471 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 OXGR1Q96P68 337 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASSF1Q9NS23 344 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOX1Q9Y5S8 564 aa24.55■■□□□ 1.52
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