RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 GABARAPO95166 117 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 SNX4O95219 450 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 TXNDC12O95881 172 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 P04436 131 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 TFPIP10646 304 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 LIFP15018 202 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 CTF1Q16619 201 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ZNF227Q86WZ6 799 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 GHDCQ8N2G8 530 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 MFSD8Q8NHS3 518 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ZNF417Q8TAU3 575 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ZPLD1Q8TCW7 415 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 TSPAN32Q96QS1 320 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 POTEKPQ9BYX7 375 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 WDR70Q9NW82 654 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 A0A087WZY1 265 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 OR6C68A6NDL8 312 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 IGHA1P01876 353 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 LIMS3P0CW19 117 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 LIMS4P0CW20 117 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ITGA3P26006 1051 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 EIF1P41567 113 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 CYB561P49447 251 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 TIGD3Q6B0B8 471 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ZBTB8AQ96BR9 441 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 TEKT2Q9UIF3 430 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 PLPP3O14495 311 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 IMPDH2P12268 514 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 DPP4P27487 766 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ADH6P28332 368 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 OR7A5Q15622 319 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 EMC4Q5J8M3 183 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 C3orf33Q6P1S2 294 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 LEG1Q6P5S2 330 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 LHFPL3Q86UP9 236 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 A0A1W2PPW3 197 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 TMEM129A0AVI4 362 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 RNF13O43567 381 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 LIPCP11150 499 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 AHCYP23526 432 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 IDUAP35475 653 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 DNASE1L1P49184 302 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 RGS6P49758 472 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 C1DQ13901 141 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 MFSD13AQ14CX5 517 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 TSTQ16762 297 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 JAZF1Q86VZ6 243 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 OPALINQ96PE5 141 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 BCL7BQ9BQE9 202 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 JAM3Q9BX67 310 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 INIPQ9NRY2 104 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 HAO2Q9NYQ3 351 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 A0A0G2JMM0 328 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 A0A1W2PPB8 328 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 A0A1W2PRS3 328 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 KIR3DP1A8MWS1 328 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 OR6A2O95222 327 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 F10P00742 488 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 AQP6Q13520 282 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 OR2G6Q5TZ20 316 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 GPR139Q6DWJ6 353 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ZNF649Q9BS31 505 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 TMEM185BQ9H7F4 350 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ASB6Q9NWX5 421 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 ERVK13-1Q9NX77 482 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 CORINQ9Y5Q5 1042 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 MED13Q9UHV7 2174 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX3-201ENST00000295927 SCG5P05408 212 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX3-201ENST00000295927 PAX7P23759 505 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX3-201ENST00000295927 WNT4P56705 351 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX3-201ENST00000295927 NFATC3Q12968 1075 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX3-201ENST00000295927 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PTX3-201ENST00000295927 MESTQ5EB52 335 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX3-201ENST00000295927 VASH2Q86V25 355 aa20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.6 ms