RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260356.5

THBS1-201, Transcript of thrombospondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS1, Length 7,775 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1-201ENST00000260356 TMEM31Q5JXX7 168 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 LFNGQ8NES3 379 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 RTP4Q96DX8 246 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SYT17Q9BSW7 474 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 APOOQ9BUR5 198 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 B3GAT1Q9P2W7 334 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SLC43A1O75387 559 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 ABOP16442 354 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 NDUFA6P56556 154 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 MBTPS1Q14703 1052 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 NR0B2Q15466 257 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SSX9Q7RTT3 188 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 IL37Q9NZH6 218 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 J3QR89 54 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 TMEM11P17152 192 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SLC36A2Q495M3 483 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SELENOIQ9C0D9 397 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 MOKQ9UQ07 419 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 A0A1W2PPH5 198 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 ZNF264O43296 627 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SLC29A1Q99808 456 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 GPR62Q9BZJ7 368 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 FBXL2Q9UKC9 423 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 PRAMEF4O60810 478 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 M6PRP20645 277 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 CD70P32970 193 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 OPCMLQ14982 345 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 VHLLQ6RSH7 139 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 NPSR1Q6W5P4 371 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 PSD2Q9BQI7 771 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 C16orf70Q9BSU1 422 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SCN9AQ15858 1988 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 OR8U8P0C7N1 319 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 LTC4SQ16873 150 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 OR5H6Q8NGV6 325 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 OR2T11Q8NH01 316 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 DUSP19Q8WTR2 217 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 REEP6Q96HR9 211 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 PIAS3Q9Y6X2 628 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SOCS6O14544 535 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 PPP1R2P9O14990 202 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 DMWDQ09019 674 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 TESK1Q15569 626 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 MISPQ8IVT2 679 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 NAT6Q93015 286 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SLC6A18Q96N87 628 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 ABHD6Q9BV23 337 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 CLMPQ9H6B4 373 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 OPA3Q9H6K4 179 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 DOCK7Q96N67 2140 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SLC16A6O15403 523 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 HPNP05981 417 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 RHOXF1Q8NHV9 184 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 A0A087WZY1 265 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 FCGR2AP12318 317 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 INHBCP55103 352 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 HBA1P69905 142 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 PLK5Q496M5 336 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 OR5M10Q6IEU7 315 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 NRIP3Q9NQ35 241 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 GM2AP17900 193 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 GATA6Q92908 595 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 ARNTLO00327 626 aa10.63□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 HTR2CP28335 458 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms