RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A0J9YW62	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658		G3V2L1	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	EFNA2	O43921	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NTS	P30990	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SFTPD	P35247	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CDKN1A	P38936	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	PKNOX1	P55347	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ATP5J2	P56134	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CD226	Q15762	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TSSK3	Q96PN8	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	MECR	Q9BV79	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A1W2PRB8	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	HS3ST1	O14792	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CLOCK	O15516	846 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NDUFS7	O75251	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SEC22B	O75396	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CRCP	O75575	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	KCNK2	O95069	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SOD3	P08294	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	MYL2	P10916	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	PRPS2	P11908	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	FCGR2A	P12318	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	AGTR1	P30556	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	THBS4	P35443	961 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	2e-6	■□□□□ 9.1
MFSD8-240	ENST00000641658	FOXF1	Q12946	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	KLF10	Q13118	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	FHL2	Q14192	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	DUSP5	Q16690	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	OSTF1	Q92882	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GIN1	Q9NXP7	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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