RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	PLOD3	O60568	738 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TFAP2A	P05549	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF35	P13682	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTM2	P28161	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GJC1	P36383	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPZA2	P47755	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	BLCAP	P62952	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PSPH	P78330	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	POU6F1	Q14863	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PHF11	Q9UIL8	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFB8	O95169	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	S1PR1	P21453	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SSR2	P43308	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TTPA	P49638	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS41	P49754	854 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PNKD	Q8N490	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF121	Q9H920	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PS29	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMA7	O14818	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF264	O43296	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GLRA3	O75311	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SAP30	O75446	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF250	P15622	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CD1D	P15813	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PIK3R1	P27986	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	NPY4R	P50391	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC16A1	P53985	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CORO7	P57737	925 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PDK2	Q15119	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR180	Q86V85	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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