RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPTA1P02549 2419 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC22A31A6NKX4 558 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 BHLHE40O14503 412 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARPC3O15145 178 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAB36O95755 333 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TFPIP10646 304 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACVR2AP27037 513 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPS5P46782 204 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTNR1AP48039 350 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUDT6P53370 316 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL10RAQ13651 578 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALG10Q5BKT4 473 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR139Q6DWJ6 353 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR5M10Q6IEU7 315 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 C3orf33Q6P1S2 294 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SIRT6Q8N6T7 355 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM41AQ96HV5 264 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RTN4RQ9BZR6 473 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 DKKL1Q9UK85 242 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 VDAC3Q9Y277 283 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GJE1A6NN92 205 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SNPHO15079 494 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 NTN1O95631 604 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP1R3DO95685 299 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 DCKP27707 260 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 HTR1FP30939 366 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 IDUAP35475 653 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF91Q05481 1191 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 POU4F2Q12837 409 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SELENBP1Q13228 472 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRAMEF20Q5VT98 475 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRG3Q86Y34 549 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 FADS6Q8N9I5 356 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR5J2Q8NH18 312 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MFSD8Q8NHS3 518 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MCCC2Q9HCC0 563 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR83Q9NYM4 423 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRHPRQ9UBQ7 328 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM72A0PK05 275 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 C2orf72A6NCS6 295 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYL12BO14950 172 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 NKX2-8O15522 239 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MT-ND2P03891 347 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CD14P08571 375 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 F8A1P23610 371 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 EFNB1P98172 346 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 PMS2P3Q13401 168 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SGCBQ16585 318 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNLSQ5VYX0 342 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCAIQ8N9R8 606 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNFT2Q96EX2 444 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MND1Q9BWT6 205 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDCA4Q9BXL8 241 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 AMBNQ9NP70 447 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 AASSQ9UDR5 926 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL20RAQ9UHF4 553 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 M0R129 80 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 XKRYO14609 159 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RENP00797 406 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 BGLAPP02818 100 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 STSP08842 583 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms