RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SLAMF7Q9NQ25 335 aa19.84■□□□□ 0.77
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PTPRM-211ENST00000580170 ACOT8O14734 319 aa19.84■□□□□ 0.77
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PTPRM-211ENST00000580170 FBXO24O75426 580 aa19.84■□□□□ 0.77
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PTPRM-211ENST00000580170 PXNP49023 591 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
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PTPRM-211ENST00000580170 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 A6NL46 340 aa19.84■□□□□ 0.77
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa19.83■□□□□ 0.77
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PTPRM-211ENST00000580170 SHC1P29353 583 aa19.83■□□□□ 0.76
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PTPRM-211ENST00000580170 OR1D4P47884 311 aa19.81■□□□□ 0.76
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PTPRM-211ENST00000580170 VRK3Q8IV63 474 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF595Q8IYB9 648 aa19.81■□□□□ 0.76
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PTPRM-211ENST00000580170 SNX11Q9Y5W9 270 aa19.81■□□□□ 0.76
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