RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR31	Q8NA23	367 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200		Q96MF0	132 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF607	Q96SK3	696 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	UPB1	Q9UBR1	384 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	RASD1	Q9Y272	281 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINB7	O75635	380 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	PNMT	P11086	282 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	MPG	P29372	298 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	MTPN	P58546	118 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	RBBP4	Q09028	425 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ULK3	Q6PHR2	472 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOA3	Q8NG57	546 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC38A4	Q969I6	547 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	BOD1	Q96IK1	185 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	19.11	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PR80	420 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	FBP2	O00757	339 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCD4	O14678	606 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A3	Q00325	362 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	TAAR8	Q969N4	342 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	19.1	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0B4J2E0	115 aa		19.09	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GX12	115 aa		19.09	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	PTAFR	P25105	342 aa		19.09	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SELENOP	P49908	381 aa		19.09	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	NFYC	Q13952	458 aa		19.09	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		19.09	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	CGB2	Q6NT52	195 aa		19.09	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		19.09	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM8	Q8N371	416 aa		19.09	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	RADIL	Q96JH8	1075 aa		19.09	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WUJ7	227 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM64B	A6NI03	449 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T1	O43869	369 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	CD8A	P01732	235 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	CD40	P25942	277 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	GZMM	P51124	257 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF83	P51522	516 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5J2	P56134	94 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	TGFBR3	Q03167	851 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1Q1	Q15612	314 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP7	Q16829	419 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP51A1	Q16850	503 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SMYD1	Q8NB12	490 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		19.08	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200		H7C1Q1	480 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200		M0QX08	132 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF432	O94892	652 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	LGI1	O95970	557 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS3BP	Q08380	585 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	SPOCK1	Q08629	439 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	LINGO2	Q7L985	606 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	DTX2	Q86UW9	622 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	POM121	Q96HA1	1249 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGDIG	Q99819	225 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		19.08	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		19.07	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R082	166 aa		19.07	■□□□□ 0.64

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