RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SPP1P10451 314 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PCMT1P22061 227 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF84P51523 738 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 RAP2BP61225 183 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 IL24Q13007 206 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF77Q15935 545 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 ACTBL2Q562R1 376 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PIGXQ8TBF5 258 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 PHYHIPQ92561 330 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 HS3ST2Q9Y278 367 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 CD70P32970 193 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 STC1P52823 247 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 C1orf61Q13536 156 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC16A9Q7RTY1 509 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 OR5M8Q8NGP6 311 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR11L1Q8NGX0 322 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC4CQ8WTT0 213 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 PRSS38A1L453 326 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 MT-ND1P03886 318 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 F3P13726 295 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF28P17035 718 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 GRB7Q14451 532 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR5K1Q8NHB7 308 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TWSG1Q9GZX9 223 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 USP3Q9Y6I4 520 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 UBR3Q6ZT12 1888 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 J3KR12 359 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0513O60268 411 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 DOK2O60496 412 aa5.87□□□□□ -1.47
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