RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	SHISA9	B4DS77	424 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	IGHV3-9	P01782	118 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PTH2R	P49190	550 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	HOXC5	Q00444	222 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	DMTN	Q08495	405 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	AAED1	Q7RTV5	226 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	UPB1	Q9UBR1	384 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	RCE1	Q9Y256	329 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137		A0A087WUJ7	227 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137		A0A0B4J2E0	115 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137		A0A1B0GX12	115 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CLOCK	O15516	846 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TPST2	O60704	377 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	RAD51D	O75771	328 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ZNF432	O94892	652 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	LGI1	O95970	557 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SOD3	P08294	240 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	INHBB	P09529	407 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	GZMM	P51124	257 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	STK11	Q15831	433 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ETFDH	Q16134	617 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	NRF1	Q16656	503 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	PGGHG	Q32M88	737 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	OXGR1	Q96P68	337 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ARHGDIG	Q99819	225 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	BDH2	Q9BUT1	245 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137		M0QX08	132 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	FBP2	O00757	339 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ABCD4	O14678	606 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CD40	P25942	277 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	PCGF2	P35227	344 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	MTPN	P58546	118 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	NFYC	Q13952	458 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SELPLG	Q14242	412 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	OR1Q1	Q15612	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	DUSP7	Q16829	419 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CYP51A1	Q16850	503 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ZNF613	Q6PF04	617 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CCDC80	Q76M96	950 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	GPAT4	Q86UL3	456 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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