RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 TNFRSF11BO00300 401 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 GNGT2O14610 69 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 GPR171O14626 319 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 AQP8O94778 261 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 IL18BPO95998 194 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 IFI30P13284 250 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 GRPRP30550 384 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 LIMS1P48059 325 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 OR4K5Q8NGD3 323 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 OR5J2Q8NH18 312 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 PFN4Q8NHR9 129 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ROBO4Q8WZ75 1007 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 SLCO4A1Q96BD0 722 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 BCO1Q9HAY6 547 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 EMC9Q9Y3B6 208 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 PCNX1Q96RV3 2341 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 OR7A10O76100 309 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 AKR7A3O95154 331 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 CH25HO95992 272 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 HIST1H2ABP04908 130 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 PTNP21246 168 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 OPRM1P35372 400 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 SLC9A3P48764 834 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ERFP50548 548 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 POU4F3Q15319 338 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 TAF11Q15544 211 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM225Q6GV28 225 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 OR52J3Q8NH60 311 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 DNAJA3Q96EY1 480 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 MOGAT1Q96PD6 335 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 PSD2Q9BQI7 771 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF724A8MTY0 619 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 M0R082 166 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 DVL2O14641 736 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 TOXO94900 526 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 FASP25445 335 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 CTSSP25774 331 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 CHRNB4P30926 498 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGDIAP52565 204 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM201Q5SNT2 666 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 FAM214BQ7L5A3 538 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM99Q8N816 258 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF417Q8TAU3 575 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ABHD3Q8WU67 409 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 FANCFQ9NPI8 374 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 C20orf141Q9NUB4 165 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0G2JNJ9 132 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PNV4 684 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ARRDC5A6NEK1 342 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 SAGP10523 405 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ADORA2A-AS1P86434 159 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 PMS2P3Q13401 168 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 GUSBP1Q15486 140 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 XKRXQ6PP77 449 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 STMN2Q93045 179 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 BDH2Q9BUT1 245 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 Q9UFV3 132 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF716A6NP11 495 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 CLOCKO15516 846 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 PIP5K1CO60331 668 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 OR10H3O60404 316 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 E2F6O75461 281 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 TIPRLO75663 272 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 CCNB2O95067 398 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 AGFG2O95081 481 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 OR6A2O95222 327 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 LDLRP01130 860 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 YES1P07947 543 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 FUT1P19526 365 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 P2RY4P51582 365 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 LTBQ06643 244 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 PUDPQ08623 228 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-218ENST00000525459 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 341.4 ms