RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	COX5A	P20674	150 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV1-2	P23083	117 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	PTAFR	P25105	342 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	MPG	P29372	298 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS2R41	P59536	307 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	PRPS1	P60891	318 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC17A1	Q14916	467 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	TAB1	Q15750	504 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA21	Q7Z572	469 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	RETREG3	Q86VR2	466 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	UEVLD	Q8IX04	471 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2T12	Q8NG77	320 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	OR6S1	Q8NH40	331 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	MPP4	Q96JB8	637 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM107B	Q9H098	131 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	MALT1	Q9UDY8	824 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A087WUJ7	227 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0B4J2E0	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GX12	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5H1	A6NKK0	313 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF726	A6NNF4	738 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	VSTM5	A8MXK1	200 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	HS3ST1	O14792	307 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	CHP2	O43745	196 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	TPST1	O60507	370 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ENTPD5	O75356	428 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	OPN1SW	P03999	348 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	UMPS	P11172	480 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	CD99	P14209	185 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	AHCY	P23526	432 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	PLAUR	Q03405	335 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	DMTN	Q08495	405 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	PMS2P3	Q13401	168 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	NPTX1	Q15818	432 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ADRM1	Q16186	407 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	PTOV1	Q86YD1	416 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	SCAI	Q8N9R8	606 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	OR52N5	Q8NH56	324 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGDIG	Q99819	225 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	LIME1	Q9H400	295 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	FKRP	Q9H9S5	495 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	RCE1	Q9Y256	329 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246		M0R3H8	397 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	FBP2	O00757	339 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	KLF4	O43474	513 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	NPIPB7	O75200	414 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	THBD	P07204	575 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	GRPR	P30550	384 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH12	P55289	794 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN17	P56750	224 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	SELPLG	Q14242	412 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF11	Q15544	211 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP7	Q16829	419 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC22A25	Q6T423	547 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC80	Q76M96	950 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF611	Q8N823	705 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	C10orf82	Q8WW14	230 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	RCN3	Q96D15	328 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	TPD52L3	Q96J77	140 aa		10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		10	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms