RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	GABRA6	Q16445	453 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	DUSP7	Q16829	419 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	VMAC	Q2NL98	169 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MMEL1	Q495T6	779 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM225	Q6GV28	225 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	GPAT4	Q86UL3	456 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SMYD1	Q8NB12	490 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR6S1	Q8NH40	331 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR10A6	Q8NH74	314 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	C10orf82	Q8WW14	230 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	LRRC58	Q96CX6	371 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MUS81	Q96NY9	551 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	NANOG	Q9H9S0	305 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	UPB1	Q9UBR1	384 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327		A0A087WUJ7	227 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CIB4	A0PJX0	185 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327		M0QX08	132 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	AIM2	O14862	343 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TPST2	O60704	377 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SMPD2	O60906	423 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OPN1SW	P03999	348 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CD99	P14209	185 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CD247	P20963	164 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TGFBR3	Q03167	851 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	BSPH1	Q075Z2	132 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SHE	Q5VZ18	495 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF613	Q6PF04	617 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC80	Q76M96	950 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	BOD1	Q96IK1	185 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	RCE1	Q9Y256	329 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ZFHX3	Q15911	3703 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ACAN	P16112	2415 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PLCE1	Q9P212	2302 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	DPRX	A6NFQ7	191 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327		M0R3H8	397 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CHP2	O43745	196 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PAX1	P15863	534 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MPG	P29372	298 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CRYBA2	P53672	197 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	VEZF1	Q14119	521 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	NPTX1	Q15818	432 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	FBXW5	Q969U6	566 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TAMM41	Q96BW9	452 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	EPYC	Q99645	322 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MCHR1	Q99705	422 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PRR14	Q9BWN1	585 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	GSX2	Q9BZM3	304 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	DLL4	Q9NR61	685 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	GID8	Q9NWU2	228 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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