RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 HMGCLP35914 325 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 HSD17B2P37059 387 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC1A2P43004 574 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD51Q06609 339 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF836Q6ZNA1 936 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8NBF4 154 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NPRL2Q8WTW4 380 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC45A3Q96JT2 553 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF597Q96LX8 424 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CHIAQ9BZP6 476 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2AG1Q9H205 316 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 JPT2Q9H910 190 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFAB1O14561 156 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 AIREO43918 545 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SOX15O60248 233 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CLPXO76031 633 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NOL4O94818 638 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC2A10O95528 541 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 LALBAP00709 142 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDOBP05062 364 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 DPEP1P16444 411 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ADORA2BP29275 332 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC1A1P43005 524 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL29P47914 159 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CX3CR1P49238 355 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC10A7Q0GE19 358 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 GPRC6AQ5T6X5 926 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 IQCKQ8N0W5 287 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM58AQ8N1B3 248 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ACOT4Q8N9L9 421 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4Q3Q8NH05 313 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF596Q8TC21 504 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 PYROXD1Q8WU10 500 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MFFQ9GZY8 342 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NEUROG2Q9H2A3 272 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM165Q9HC07 324 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 IMPAD1Q9NX62 359 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 STAP1Q9ULZ2 295 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 PLLPQ9Y342 182 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 A8MXK9 166 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 K7ENP7 123 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 M0R3G1 203 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 DCTN6O00399 190 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NR5A2O00482 541 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R2P9O14990 202 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 RRP8O43159 456 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ERLIN2O94905 339 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 STAMBPO95630 424 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 AMBPP02760 352 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 C2P06681 752 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 UGT1A4P22310 534 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CD82P27701 267 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEA9P43362 315 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 GSSP48637 474 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNG1P51959 295 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN18P56856 261 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXW4P57775 412 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ERVPABLB-1P60509 514 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRNB3Q05901 458 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SLAQ13239 276 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 LY6DQ14210 128 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 LTB4RQ15722 352 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT71Q3SY84 523 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 PPM1LQ5SGD2 360 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 H3F3CQ6NXT2 135 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CERS6Q6ZMG9 384 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 TMUB2Q71RG4 321 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 C4orf32Q8N8J7 132 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms