RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	USP22	Q9UPT9	525 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880		M0R082	166 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	FXYD1	O00168	92 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T1	O43869	369 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SMPD2	O60906	423 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINI2	O75830	405 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	LGI1	O95970	557 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	COX4I1	P13073	169 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF43	P17038	809 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CD247	P20963	164 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	GRPR	P30550	384 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NTF4	P34130	210 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CDH12	P55289	794 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	EGR4	Q05215	589 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ACKR1	Q16570	336 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TAAR8	Q969N4	342 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	EPYC	Q99645	322 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ASPN	Q9BXN1	380 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0B4J2E0	115 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GX12	115 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OR5H1	A6NKK0	313 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880		M0R1B8	84 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPB7	O75200	414 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	VAMP5	O95183	116 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NPPA	P01160	153 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CD53	P19397	219 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	COX5A	P20674	150 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SELENOP	P49908	381 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF83	P51522	516 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	GYS2	P54840	703 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN17	P56750	224 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	DEF8	Q6ZN54	512 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PIGT	Q969N2	578 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TPD52L3	Q96J77	140 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WUJ7	227 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	GSTA4	O15217	222 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A2	O15244	555 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TPST2	O60704	377 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	IFNA14	P01570	189 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	C8B	P07358	591 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	UMPS	P11172	480 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF1B	P20333	461 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT2	P50583	147 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R41	P59536	307 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	GNGT1	P63211	74 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	LGALS3BP	Q08380	585 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PMS2P3	Q13401	168 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NRF1	Q16656	503 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32

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