RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470563.5

RBM39-227, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 3

Gene RBM39, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-227	ENST00000470563	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PEX13	Q92968	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TAMM41	Q96BW9	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CIB1	Q99828	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CTRC	Q99895	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	LHX3	Q9UBR4	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NUP205	Q92621	2012 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	DLGAP1	O14490	977 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	INPP4B	O15327	924 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	MAGEB3	O15480	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	MFSD11	O43934	449 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	UGT2B11	O75310	529 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NXPH2	O95156	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GABARAP	O95166	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FGF4	P08620	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GFAP	P14136	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	IL1RN	P18510	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FUT1	P19526	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CYP2B6	P20813	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	HTR1E	P28566	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PKLR	P30613	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SERPINB1	P30740	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	AKT2	P31751	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TNFSF9	P41273	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GSS	P48637	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ERF	P50548	548 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SLC7A2	P52569	658 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FUT7	Q11130	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PEX6	Q13608	980 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GK3P	Q14409	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	UPP1	Q16831	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	DGUOK	Q16854	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	AGK	Q53H12	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563		Q6ZRP5	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NPAS2	Q99743	824 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PARL	Q9H300	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms