RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.7□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.7□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SCN2AQ99250 2005 aa6.7□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 CLDN25C9JDP6 229 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 LGALS8O00214 317 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SULT1C2O00338 296 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 PIP5K1BO14986 540 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 RGS10O43665 173 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 DNAJA2O60884 412 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 FKBP6O75344 327 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SCO1O75880 301 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ADAP00813 363 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 MT-ATP6P00846 226 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 TK1P04183 234 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 IFNGR1P15260 489 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SAT1P21673 171 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ITGA3P26006 1051 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 GCAP28676 217 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SDHAP31040 664 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 MAGEA12P43365 314 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 TGM4P49221 684 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 RRADP55042 308 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 GFRA1P56159 465 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB10P61026 200 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 CDKL1Q00532 357 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 BTN1A1Q13410 526 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 MED22Q15528 200 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 TRIP10Q15642 601 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 GUK1Q16774 197 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 CDNFQ49AH0 187 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 Q6ZS92 163 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 OR56A3Q8NH54 315 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB24Q969Q5 203 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 FBXL8Q96CD0 374 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 C14orf144Q96I85 54 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4K3Q96R72 315 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 PAFAH2Q99487 392 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 CITED1Q99966 193 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 EQTNQ9NQ60 294 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 COPZ2Q9P299 210 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 OARD1Q9Y530 152 aa6.69□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 SVILO95425 2214 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A0G2JMP0 313 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 FITM1A5D6W6 292 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 URADA6NGE7 173 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 MPTX1A8MV57 137 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 E7EQ34 232 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF749O43361 778 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 B4GALT2O60909 372 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ALOX12BO75342 701 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2B3O76000 313 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 PPBPP02775 128 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 HEXAP06865 529 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 MELTFP08582 738 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 COX6B1P14854 86 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ACPPP15309 386 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 CD1DP15813 335 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 PPP3CBP16298 524 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 CNR1P21554 472 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ZP3P21754 424 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 ME2P23368 584 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 HTR1EP28566 365 aa6.68□□□□□ -1.34
RPUSD3-212ENST00000466141 IL12AP29459 219 aa6.68□□□□□ -1.34
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