RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 TMPRSS2O15393 492 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 NPIPB7O75200 414 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ENTPD5O75356 428 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 GADD45GO95257 159 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 AHSA1O95433 338 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 CST1P01037 141 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 THRBP10828 461 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 IDUAP35475 653 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 DIO1P49895 249 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 MAP2K6P52564 334 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 SMIM11AP58511 58 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PON3Q15166 354 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 SEC23BQ15437 767 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 FGD3Q5JSP0 725 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 RTL6Q6ICC9 239 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 RPTNQ6XPR3 784 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM239Q8WW34 195 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 AP4S1Q9Y587 144 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PRQ8 180 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 LIPT2A6NK58 231 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ENO4A6NNW6 628 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CCL21O00585 134 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 GNGT2O14610 69 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CLOCKO15516 846 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR1O75083 606 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 AKR7A3O95154 331 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SYNGR4O95473 234 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 PMS2P2O95744 297 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 TGM6O95932 706 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CH25HO95992 272 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 BGLAPP02818 100 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 IFI30P13284 250 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 GABRA1P14867 456 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 FUT1P19526 365 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 MAKP20794 623 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 FPR1P21462 350 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ENPP1P22413 925 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ACVR2AP27037 513 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CA7P43166 264 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 IST1P53990 364 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CASP6P55212 293 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 RAC3P60763 192 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35A1P78382 337 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 DGCR6Q14129 220 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 RRM2BQ7LG56 351 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 AMIGO2Q86SJ2 522 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 NRMQ8IXM6 262 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM99Q8N816 258 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SGTBQ96EQ0 304 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 MOGAT1Q96PD6 335 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 EPYCQ99645 322 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 FUZQ9BT04 418 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 YY1AP1Q9H869 796 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 REEP1Q9H902 201 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CALHM2Q9HA72 323 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 S100A14Q9HCY8 104 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 TIGARQ9NQ88 270 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms