RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442406.5

EIF4G1-222, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1, human

TSL 1 (best)

Gene EIF4G1, Length 5,129 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EIF4G1-222	ENST00000442406	LCAT	P04180	440 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	FOSL2	P15408	326 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406		F5H5K5	113 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	CEACAM5	P06731	702 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ADH6	P28332	368 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	MTFR2	Q6P444	385 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	TM9SF4	Q92544	642 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	YIPF6	Q96EC8	236 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ARPC5	O15511	151 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	DPM1	O60762	260 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	EID2B	Q96D98	161 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	CHRD	Q9H2X0	955 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	TTC3	P53804	2025 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	CIB4	A0PJX0	185 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406		H0Y8X5	98 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	MEN1	O00255	615 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC43A1	O75387	559 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ETV5	P41161	510 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ETV1	P50549	477 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	OXA1L	Q15070	435 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406		M0R036	132 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SCRG1	O75711	98 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	PFN4	Q8NHR9	129 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	GLCE	O94923	617 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	HTR3B	O95264	441 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SHH	Q15465	462 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ARL14	Q8N4G2	192 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	LRFN5	Q96NI6	719 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	TEAD3	Q99594	435 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406		A0A087WV62	115 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	P2RX6	O15547	441 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	FGF17	O60258	216 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	GPX5	O75715	221 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SBK2	P0C263	348 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	CPE	P16870	476 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	MAOA	P21397	527 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC14A1	Q13336	389 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	MAK	P20794	623 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	CCR5	P51681	352 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SELENOV	P59797	346 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EIF4G1-222	ENST00000442406	TXNDC15	Q96J42	360 aa		13.12	□□□□□ -0.31

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