RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438265.5

RPE-211, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 3

Gene RPE, Length 668 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-211ENST00000438265 AQP8O94778 261 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PRKD3O94806 890 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 VAMP5O95183 116 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 AHSA1O95433 338 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OPN1SWP03999 348 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PRG2P13727 222 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ENPP1P22413 925 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 HTR2AP28223 471 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SHC1P29353 583 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 IDUAP35475 653 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CPOXP36551 454 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SIRPAP78324 504 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MXRA7P84157 204 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 H3F3AP84243 136 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 KEAP1Q14145 624 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OR1Q1Q15612 314 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 DNAL1Q4LDG9 190 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 COMTD1Q86VU5 262 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CADM2Q8N3J6 435 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SMYD1Q8NB12 490 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ELOA3Q8NG57 546 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MCHR1Q99705 422 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CD300AQ9UGN4 299 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.35□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 A0A1W2PNR3 127 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 LIPT2A6NK58 231 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 AQP7P3A6NL99 342 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 H7C1Q1 480 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ATP5HO75947 161 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OR5F1O95221 314 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MT-ATP6P00846 226 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OPN1LWP04000 364 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 IFNW1P05000 195 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 INHBBP09529 407 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TFPIP10646 304 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 AGTR1P30556 359 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CPA2P48052 419 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 RASSF2P50749 326 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CTBP2P56545 445 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 NPTX1Q15818 432 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 IFI44LQ53G44 452 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SSX8Q7RTT4 187 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 STK32CQ86UX6 486 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CARM1Q86X55 608 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 KIF18BQ86Y91 864 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SCAIQ8N9R8 606 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FAM162AQ96A26 154 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ARL5BQ96KC2 179 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 C18orf12Q96KH6 178 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PRRC1Q96M27 445 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 Q96MF0 132 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 DACH2Q96NX9 599 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PSD2Q9BQI7 771 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OR10A4Q9H209 315 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ADA2Q9NZK5 511 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.34□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.33□□□□□ -1.24
RPE-211ENST00000438265 ZNF716A6NP11 495 aa7.33□□□□□ -1.24
RPE-211ENST00000438265 B2RBV5 119 aa7.33□□□□□ -1.24
RPE-211ENST00000438265 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.33□□□□□ -1.24
RPE-211ENST00000438265 M0R3H8 397 aa7.33□□□□□ -1.24
RPE-211ENST00000438265 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RPE-211ENST00000438265 KLF4O43474 513 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms