RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 SFRP5Q5T4F7 317 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 C1orf198Q9H425 327 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NENFQ9UMX5 172 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NME7Q9Y5B8 376 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CDHR4A6H8M9 788 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 KCNK5O95279 499 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MANEAQ5SRI9 462 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CD300AQ9UGN4 299 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 SLC22A7Q9Y694 548 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF749O43361 778 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 LPLP06858 475 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 KCNAB1Q14722 419 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TAZQ16635 292 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MAVSQ7Z434 540 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 SEMA6CQ9H3T2 930 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GALNT9Q9HCQ5 603 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1B0GWA3 101 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ARHGAP33O14559 1287 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 FZD7O75084 574 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RFPL3O75679 317 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ICAM2P13598 275 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TAS2R19P59542 299 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 C12orf49Q9H741 205 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 P2RY10O00398 339 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RNF128Q8TEB7 428 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MALSU1Q96EH3 234 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CSNK1G2P78368 415 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 EMC9Q9Y3B6 208 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PTAFRP25105 342 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CARD18P57730 90 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RBPJQ06330 500 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GHSRQ92847 366 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NOX4Q9NPH5 578 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PRAF2O60831 178 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ABLIM3O94929 683 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NPPBP16860 134 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TPMTP51580 245 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MZT1Q08AG7 82 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CHD4Q14839 1912 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 DNAJC22Q8N4W6 341 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 L3MBTL4Q8NA19 623 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 BORCS7Q96B45 105 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 SCN11AQ9UI33 1791 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 POM121CA8CG34 1229 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ENSAO43768 121 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PTHP01270 115 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 SHC1P29353 583 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PRKAR1BP31321 381 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CRMP1Q14194 572 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 DUSP13Q9UII6 198 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 A0A087WUU8 490 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 IGHV3-9P01782 118 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 SLC1A3P43003 542 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NPSR1Q6W5P4 371 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 OSGIN1Q9UJX0 560 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TCN2P20062 427 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MPEG1Q2M385 716 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 BATF2Q8N1L9 274 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 KDM8Q8N371 416 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TEX37Q96LM6 180 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 C1GALT1Q9NS00 363 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RGPD5Q99666 1765 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 DPM1O60762 260 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 FBXO24O75426 580 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 STK17BO94768 372 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 DDAH2O95865 285 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF511Q8NB15 262 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GIMAP1Q8WWP7 306 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TAAR8Q969N4 342 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RPH3ALQ9UNE2 315 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1B0GVG6 124 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms