RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	STON2	Q8WXE9	905 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PR80	420 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NR5A2	O00482	541 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	VAMP5	O95183	116 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GPX2	P18283	190 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MPG	P29372	298 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXC5	Q00444	222 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SPOCK1	Q08629	439 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	AAED1	Q7RTV5	226 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	COMTD1	Q86VU5	262 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NFKBID	Q8NI38	313 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf10	Q9HB07	376 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		15.54	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	15.53	■□□□□ 0.08	2e-7	■■□□□ 12.1
MRPL28-203	ENST00000429738	C5orf58	C9J3I9	102 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		E7EQL1	145 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ACVR1B	P36896	505 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF83	P51522	516 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A3	Q00325	362 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TGFBR3	Q03167	851 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SQLE	Q14534	574 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM225	Q6GV28	225 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	REEP3	Q6NUK4	255 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GPAT4	Q86UL3	456 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		15.53	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV4-39	P01824	125 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	HTR2A	P28223	471 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TTK	P33981	857 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CDK6	Q00534	326 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ADRM1	Q16186	407 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	AGK	Q53H12	422 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ALG2	Q9H553	416 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RASD1	Q9Y272	281 aa		15.52	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R1B8	84 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TPST1	O60507	370 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFS7	O75251	213 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	AHSA1	O95433	338 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PNMT	P11086	282 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SELENOP	P49908	381 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	AGAP6	Q5VW22	663 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A25	Q6T423	547 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGEB18	Q96M61	343 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		15.51	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GWA3	101 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	C8B	P07358	591 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SCARB2	Q14108	478 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	LINGO2	Q7L985	606 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	HDX	Q7Z353	690 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT73	Q86Y46	540 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ELOA3	Q8NG57	546 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07

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