RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427868.6

LINC00665-202, long intergenic non-protein coding RNA 665, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00665, Length 690 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00665-202ENST00000427868 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 RASD1Q9Y272 281 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 DSCAMO60469 2012 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 A0A1B0GWA3 101 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 PDLIM1O00151 329 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 AIM2O14862 343 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 OR2T1O43869 369 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 TPST1O60507 370 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 NPIPB7O75200 414 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 HEXAP06865 529 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 DANCRP0C864 163 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 PNMTP11086 282 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 ZNF43P17038 809 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 PTNP21246 168 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 CBLP22681 906 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 CD40P25942 277 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 HTR2AP28223 471 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SELENOPP49908 381 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 FABP6P51161 128 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 MTPNP58546 118 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 PRPS1P60891 318 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 ETFDHQ16134 617 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 PGGHGQ32M88 737 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 AGAP6Q5VW22 663 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 ULK3Q6PHR2 472 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 KDM8Q8N371 416 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SMYD1Q8NB12 490 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 STON2Q8WXE9 905 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 POM121Q96HA1 1249 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 CGREF1Q99674 301 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 PIF1Q9H611 641 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 C12orf10Q9HB07 376 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 E7EQL1 145 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 M0R082 166 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 M0R3H8 397 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 OVOL3O00110 214 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SLC43A1O75387 559 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SASH3O75995 380 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 LY6G6DO95868 133 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 LGI1O95970 557 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 OPN1SWP03999 348 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 GRPRP30550 384 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 P2RY4P51582 365 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 CLDN17P56750 224 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SLC25A3Q00325 362 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 EGR4Q05215 589 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 LGALS3BPQ08380 585 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 DMTNQ08495 405 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 RBBP4Q09028 425 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 TNK1Q13470 666 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 OR1Q1Q15612 314 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 ADRM1Q16186 407 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 MMEL1Q495T6 779 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00665-202ENST00000427868 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms