RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 PAX6P26367 422 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OMPP47874 163 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PGFP49763 221 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 B2MP61769 119 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HERV-K104P63124 156 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CNTN1Q12860 1018 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLAQ13239 276 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TAB1Q15750 504 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRIQKQ629K1 86 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF544Q6NX49 715 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TTLL10Q6ZVT0 673 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PELI3Q8N2H9 469 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF614Q8N883 585 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C8orf31Q8N9H6 132 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NECAP1Q8NC96 275 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC18CQ8NCF0 446 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR6K2Q8NGY2 324 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MARCH1Q8TCQ1 289 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PROKR1Q8TCW9 393 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ST8SIA1Q92185 356 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM143Q96AN5 459 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF524Q96C55 264 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CSF3RQ99062 836 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC3Q9BQI4 270 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MED18Q9BUE0 208 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ATG5Q9H1Y0 275 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C14orf105Q9NVL8 296 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC9A2Q9UBY0 812 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BTRCQ9Y297 605 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KPTNQ9Y664 436 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BTBD17A6NE02 478 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR2AT4A6NND4 320 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 F8VP50 259 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC16A4O15374 487 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CLOCKO15516 846 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KCNN4O15554 427 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RBBP9O75884 186 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAB3DO95716 219 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LAP3P28838 519 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SDC4P31431 198 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LIMS1P48059 325 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 THOP1P52888 689 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CDH6P55285 790 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TAS2R39P59534 338 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 S100A10P60903 97 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC35A2P78381 396 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SRYQ05066 204 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BCL2L1Q07817 233 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 IL10RBQ08334 325 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PPIL2Q13356 520 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SNTA1Q13424 505 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 VGLL4Q14135 290 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 POU6F1Q14863 301 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ELOCQ15369 112 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP6Q16828 381 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ABCA11PQ4W5N1 156 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PDSS1Q5T2R2 415 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LIPKQ5VXJ0 399 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LEG1Q6P5S2 330 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EMBQ6PCB8 327 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF836Q6ZNA1 936 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 S100A7AQ86SG5 101 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00523Q86TU6 105 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MISPQ8IVT2 679 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ELMOD1Q8N336 334 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DHRSXQ8N5I4 330 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ACBD4Q8NC06 268 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR7G2Q8NG99 324 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ANGPTL6Q8NI99 470 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 STOML3Q8TAV4 291 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CYGBQ8WWM9 190 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NR4A3Q92570 626 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CAPNS2Q96L46 248 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SIGLEC10Q96LC7 697 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HSFY1Q96LI6 401 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DDOQ99489 341 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MACROD1Q9BQ69 325 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PCGF1Q9BSM1 259 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FUCA2Q9BTY2 467 aa2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.6 ms