RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FHITP49789 147 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RCN1Q15293 331 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 P2RY14Q15391 338 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZNF74Q16587 644 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FAM106AQ4KMX7 169 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZCWPW2Q504Y3 356 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TAF3Q5VWG9 929 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SYT10Q6XYQ8 523 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TMEM135Q86UB9 458 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.75□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 KBTBD8Q8NFY9 601 aa4.75□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 OR8J1Q8NGP2 316 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 OR1L3Q8NH93 324 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SLC37A2Q8TED4 501 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CT55Q8WUE5 264 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PATE1Q8WXA2 126 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 OMA1Q96E52 524 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ST6GAL2Q96JF0 529 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ETNK2Q9NVF9 386 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FZR1Q9UM11 496 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FKBP7Q9Y680 259 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RP1P56715 2156 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GOLGA8OA6NCC3 632 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 HELTA6NFD8 242 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZNF716A6NP11 495 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GOLGA8NF8WBI6 632 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 K7EM74 188 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PSMD11O00231 422 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SLC1A7O00341 560 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 KLF11O14901 512 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SCRG1O75711 98 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 IGHV4-59P01825 116 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CAPN1P07384 714 aa4.74□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 ZNF735P0CB33 412 aa4.74□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NDUFA8P51970 172 aa4.74□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 AP1S1P61966 158 aa4.74□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 PJVKQ0ZLH3 352 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PNOCQ13519 176 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PTPN20Q4JDL3 420 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PHYHD1Q5SRE7 291 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TMEM225Q6GV28 225 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FAM92BQ6ZTR7 304 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 Q6ZVQ6 151 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 C16orf62Q7Z3J2 963 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FAM172AQ8WUF8 416 aa4.74□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CD84Q9UIB8 345 aa4.74□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RNF6Q9Y252 685 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 LRP12Q9Y561 859 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 AP4B1Q9Y6B7 739 aa4.74□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa4.73□□□□□ -1.65
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