RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 THAP1Q9NVV9 213 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 RASD1Q9Y272 281 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 GPR45Q9Y5Y3 372 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 VSTM5A8MXK1 200 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 IL12AP29459 219 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 BNIP2Q12982 314 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 C6orf10Q5SRN2 563 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 C1orf140Q5VVS0 124 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ATG16L1Q676U5 607 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 NIPAL3Q6P499 406 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ITCHQ96J02 903 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 KCNS2Q9ULS6 477 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 NDUFS8O00217 210 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 LGI1O95970 557 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ETFAP13804 333 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 HNF1AP20823 631 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 TBRG1Q3YBR2 411 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 RNF220Q5VTB9 566 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 OR1K1Q8NGR3 316 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 MGARPQ8TDB4 240 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 SLC25A36Q96CQ1 311 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM160Q9NX00 188 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 IFT52Q9Y366 437 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 A0A096LNT2 108 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 FRS3O43559 492 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 LMX1BO60663 402 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 TFPTP0C1Z6 253 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 SERPINF1P36955 418 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 IL1RL1Q01638 556 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 IQCCQ4KMZ1 466 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 VHLLQ6RSH7 139 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 PHC2Q8IXK0 858 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 C3orf49Q96BT1 292 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 KATNB1Q9BVA0 655 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 TPT1P8Q9HAU6 139 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 A0A0G2JPF8 293 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 B9A039 149 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 C5orf58C9J3I9 102 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 LY6HO94772 140 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 IGHV4-31P0DP07 118 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF43P17038 809 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 SELENOPP49908 381 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 MPP2Q14168 576 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF311Q5JNZ3 666 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 FAM166AQ6J272 317 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 CREB3L2Q70SY1 520 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 STK35Q8TDR2 534 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM19Q96HH6 336 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 CHODLQ9H9P2 273 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 CA10Q9NS85 328 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 DSPPQ9NZW4 1301 aa20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 APEHP13798 732 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 C1DQ13901 141 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ANKRD16Q6P6B7 361 aa20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 ZIM2Q9NZV7 527 aa20.33■□□□□ 0.85
TMEM54-201ENST00000329151 A0A096LPE4 126 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 A0A1W2PPZ6 126 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 SRD5A1P18405 259 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 SERPINA11Q86U17 422 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 CLIP4Q8N3C7 705 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 GPR137CQ8N3F9 429 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 OR4F15Q8NGB8 312 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 MFSD8Q8NHS3 518 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 SORCS2Q96PQ0 1159 aa20.32■□□□□ 0.84
TMEM54-201ENST00000329151 RAB1BQ9H0U4 201 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms