RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 POLE3Q9NRF9 147 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP50Q9UKX7 468 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A096LPE4 126 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPZ6 126 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM129A0AVI4 362 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ESPNB1AK53 854 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIAL4DF5H284 164 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SCN2BO60939 215 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXH1O75593 365 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF432O94892 652 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNA2P20248 432 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NR4A1P22736 598 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPH2P23942 346 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCR1P25024 350 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 COL8A2P25067 703 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NTF4P34130 210 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 LMO4P61968 165 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 HGFACQ04756 655 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE7AQ13946 482 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 HFEQ30201 348 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NIPAL3Q6P499 406 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 BRICD5Q6PL45 260 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CMIPQ8IY22 773 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF217Q8TC41 542 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 EGLN2Q96KS0 407 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TSSK3Q96PN8 268 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 OR7D2Q96RA2 312 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNA7Q96RP8 456 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GAL3ST1Q99999 423 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MRI1Q9BV20 369 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NOX3Q9HBY0 568 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DECR2Q9NUI1 292 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP13Q9UII6 198 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RASD1Q9Y272 281 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TGP01266 2768 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A096LPI6 279 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 AGAP5A6NIR3 686 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC43A1O75387 559 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB36O95755 333 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 HPXP02790 462 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GUSBP08236 651 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF43P17038 809 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MATN1P21941 496 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PCGF2P35227 344 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SOAT1P35610 550 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 COPZ1P61923 177 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MVKQ03426 396 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCD1Q15116 288 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 OR7A5Q15622 319 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTA3Q16772 222 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATC1Q76KD6 591 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PAFAH2Q99487 392 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT3Q9BQG1 590 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MID2Q9UJV3 735 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RCE1Q9Y256 329 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR45Q9Y484 360 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 AUP1Q9Y679 476 aa6.75□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.74□□□□□ -1.33
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