RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 A0A1W2PS29 197 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TO15178 435 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 GLI4P10075 376 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 PXT1Q8NFP0 134 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TOMM40LQ969M1 308 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ARL11Q969Q4 196 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SLC35A4Q96G79 324 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SLC16A7O60669 478 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ATG12O94817 140 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 KAT7O95251 611 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 OPRD1P41143 372 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 KDM8Q8N371 416 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 FBXW5Q969U6 566 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 FBRSQ9HAH7 460 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 MEMO1Q9Y316 297 aa14.53□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CSRP3P50461 194 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TSC22D1Q15714 1073 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ALG11Q2TAA5 492 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 MPP7Q5T2T1 576 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 GPA33Q99795 319 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 LAMB2P55268 1798 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 IDSB3KWA1 339 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 HPXP02790 462 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 MSL3P1P0C860 447 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 AMY2BP19961 511 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 LINC00303Q3SY05 128 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CAPNS2Q96L46 248 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ADOQ96SZ5 270 aa14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TPOP07202 933 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 GP1BBP13224 206 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 AKR1C3P42330 323 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CST6Q15828 149 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 COX15Q7KZN9 410 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 EGFP01133 1207 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 HOXB2P14652 356 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 OR7A5Q15622 319 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 C12orf73Q69YU5 71 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 DPF3Q92784 378 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 LINC00052Q96N35 136 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 PHB2Q99623 299 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 FANCFQ9NPI8 374 aa14.52□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 LRIT2A6NDA9 550 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SURF4O15260 269 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 NME2P22392 152 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CBFBQ13951 182 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CRB3Q9BUF7 120 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 HIDE1A8MVS5 230 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 UBBP0CG47 229 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 NDUFS1P28331 727 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SELENOPP49908 381 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 GUCA2AQ02747 115 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 LIPNQ5VXI9 398 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 NIPAL3Q6P499 406 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CSF1P09603 554 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms