RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 OR3A3P47888 321 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CCR5P51681 352 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 LTBQ06643 244 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GATSQ8NAP1 163 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ASB13Q8WXK3 278 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GABRG3Q99928 467 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 RNF32Q9H0A6 362 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF749O43361 778 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MAS1P04201 325 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 EPXP11678 715 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF20P17024 532 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SPI1P17947 270 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 UQCRC1P31930 480 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 E2F1Q01094 437 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 FUT5Q11128 374 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 APOOLQ6UXV4 268 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CHST4Q8NCG5 386 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR5J2Q8NH18 312 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NMNAT3Q96T66 252 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 F5H5P2 479 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR2T1O43869 369 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A1P30531 599 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CCKBRP32239 447 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SCAND1P57086 179 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TDGQ13569 410 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TRILQ7L0X0 811 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 STARD5Q9NSY2 213 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NUP50Q9UKX7 468 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CYB5AP00167 134 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A1P53007 311 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ISXQ2M1V0 245 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 RBP7Q96R05 134 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GUH1 482 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ARPC3O15145 178 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OGG1O15527 345 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SCO2O43819 266 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TPOP07202 933 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 EGR3Q06889 387 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF141Q15928 474 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NNATQ16517 81 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZG16BQ96DA0 208 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NSA2O95478 260 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MT-ATP6P00846 226 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PTGS2P35354 604 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PPP2CBP62714 309 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PPP2CAP67775 309 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CDONQ4KMG0 1287 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TMEM17Q86X19 198 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 BCORP1Q8N888 145 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 FAM46BQ96A09 425 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 KCNJ15Q99712 375 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CMKLR1Q99788 373 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GPR174Q9BXC1 333 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GLS2Q9UI32 602 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CA5BQ9Y2D0 317 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CDC42EP2O14613 210 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 EMDP50402 254 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R19P59542 299 aa8.12□□□□□ -1.11
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