RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 WBP1Q96G27 269 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 C10orf90Q96M02 699 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 LYSMD1Q96S90 227 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 ZNF649Q9BS31 505 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 HRH4Q9H3N8 390 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 IL21RQ9HBE5 538 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 GBF1Q92538 1859 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 IFITM5A6NNB3 132 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 SELENOFO60613 162 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 ITGA10O75578 1167 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 NDUFB6O95139 128 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 CRYBA1P05813 215 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 CNR1P21554 472 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 NFYBP25208 207 aa6.15□□□□□ -1.42
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LMO3-235ENST00000616247 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 SHC2P98077 582 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 FUT5Q11128 374 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 DECR1Q16698 335 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 HFEQ30201 348 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.15□□□□□ -1.42
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LMO3-235ENST00000616247 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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LMO3-235ENST00000616247 SGPP1Q9BX95 441 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 KCNK15Q9H427 330 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 MED17Q9NVC6 651 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 CTSFQ9UBX1 484 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-235ENST00000616247 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.15□□□□□ -1.42
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LMO3-235ENST00000616247 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.15□□□□□ -1.43
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LMO3-235ENST00000616247 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 NT5EP21589 574 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 HTR2AP28223 471 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 CSF2RBP32927 897 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 METAP1P53582 386 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 BTN3A2P78410 334 aa6.15□□□□□ -1.43
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LMO3-235ENST00000616247 MORN1Q5T089 497 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 AVPI1Q5T686 147 aa6.15□□□□□ -1.43
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LMO3-235ENST00000616247 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 SPICQ8N5J4 248 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.15□□□□□ -1.43
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LMO3-235ENST00000616247 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 PBX4Q9BYU1 374 aa6.15□□□□□ -1.43
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LMO3-235ENST00000616247 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 NPTNQ9Y639 398 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.14□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 LRRC72A6NJI9 287 aa6.14□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 MAN2B1O00754 1011 aa6.14□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 IMPA2O14732 288 aa6.14□□□□□ -1.43
LMO3-235ENST00000616247 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.14□□□□□ -1.43
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