RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611848.1

SMAD4-217, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,648 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-217ENST00000611848 AQP7O14520 342 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 ADAM10O14672 748 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 NDUFB5O43674 189 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 SLC19A2O60779 497 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 CLPXO76031 633 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 STSP08842 583 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 ABOP16442 354 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PSMB9P28065 219 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 MSX1P28360 303 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 SRD5A2P31213 254 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PTGS2P35354 604 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 GSSP48637 474 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 CASP6P55212 293 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 COX10Q12887 443 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 GPR68Q15743 365 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 GPAT3Q53EU6 434 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 KLHL26Q53HC5 615 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM201Q5SNT2 666 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 APOOLQ6UXV4 268 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 OLIG3Q7RTU3 272 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 P2RY8Q86VZ1 359 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 FADS6Q8N9I5 356 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 NEIL3Q8TAT5 605 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 DUSP19Q8WTR2 217 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 SARAFQ96BY9 339 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 ARHGDIGQ99819 225 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 SAP130Q9H0E3 1048 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 EXO5Q9H790 373 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 IMPAD1Q9NX62 359 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 OSGIN2Q9Y236 505 aa8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 LRRK2Q5S007 2527 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 A0A1B0GUH1 482 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 M0R3H8 397 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PRRG2O14669 202 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 OR10H3O60404 316 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 UGT2B17O75795 530 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 LCKP06239 509 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 CELA3AP09093 270 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 SLC15A1P46059 708 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 UGT2B15P54855 530 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 HSF1Q00613 529 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 TOMM20Q15388 145 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF141Q15928 474 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 C4orf17Q53FE4 359 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 C12orf73Q69YU5 71 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PMM1Q92871 262 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 SLC38A4Q969I6 547 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PRRC1Q96M27 445 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 DSN1Q9H410 356 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 MED11Q9P086 117 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 MKLN1Q9UL63 735 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 WDR45Q9Y484 360 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.99□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 M0R082 166 aa7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 KIAA0513O60268 411 aa7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 FCMRO60667 390 aa7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 NPIPA8P0DM63 369 aa7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 DPP4P27487 766 aa7.98□□□□□ -1.13
SMAD4-217ENST00000611848 PRKAR1BP31321 381 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms