RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP4Z1Q86W10 505 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 P3H2Q8IVL5 708 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRGUKQ96M69 825 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC19A3Q9BZV2 496 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 GP6Q9HCN6 339 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFAF4Q9P032 175 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCRBV5S2A0A599 114 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 FTCDNL1E5RQL4 147 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK2P20151 261 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM214BQ7L5A3 538 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6S1Q8NH40 331 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAAR8Q969N4 342 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 FNDC11Q9BVV2 318 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM15Q9C019 465 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 FFAR1O14842 300 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS23O95084 383 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGA2P17301 1181 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTNP21246 168 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM34P42696 430 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKAIN4Q8IVV8 208 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSD2Q9BQI7 771 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 hCG_2039718K7EN88 272 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 FZD7O75084 574 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHCEP18577 417 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGXQ8TBF5 258 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A36Q96CQ1 311 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL13Q9P2N7 655 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC7A8Q9UHI5 535 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC4AQ9UMR7 237 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMC9Q9Y3B6 208 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTBP2P56545 445 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 MFSD13AQ14CX5 517 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 HS6ST2Q96MM7 605 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCO1Q9HAY6 547 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL1RAPQ9NPH3 570 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHCGQ9UBD6 479 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 POMPQ9Y244 141 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM90A27PA6NNH2 459 aa29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF814B7Z6K7 855 aa29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKR7A3O95154 331 aa29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIRPAP78324 504 aa29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQCCQ4KMZ1 466 aa29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC103Q8IW40 242 aa29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM255BQ8WV15 326 aa29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICE1Q9Y2F5 2266 aa29.51■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 AQP7P3A6NL99 342 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 FABP3P05413 133 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 FLOT2Q14254 428 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAM2Q15035 370 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDK3Q15120 406 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 VWA1Q6PCB0 445 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASRGL1Q7L266 308 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM99Q8N816 258 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM239Q8WW34 195 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 STARD4Q96DR4 205 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEPHS2Q99611 448 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 UCK2Q9BZX2 261 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL4Q9C0H6 718 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGMQ9H3S5 423 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGIXQ9H6Y5 334 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNJ16Q9NPI9 418 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAHCC1Q9P281 2608 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 AQP12BA6NM10 295 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 YES1P07947 543 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGTR1P30556 359 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUSC5Q8IXB3 177 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 AQP12AQ8IXF9 295 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD19PQ9H560 264 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAMP1O60894 148 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT-ATP6P00846 226 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 BGLAPP02818 100 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM201Q5SNT2 666 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3C3Q8NEB9 887 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6K3Q8NGY3 331 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIP5K1AQ99755 562 aa29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms