RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	P3H2	Q8IVL5	708 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	STK35	Q8TDR2	534 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	APH1A	Q96BI3	265 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	TAMM41	Q96BW9	452 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	LRRC58	Q96CX6	371 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	USP22	Q9UPT9	525 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996		M0QX08	132 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996		M0R3H8	397 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	FZD7	O75084	574 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	SERPINB7	O75635	380 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	KRT34	O76011	436 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	CD247	P20963	164 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	KEAP1	Q14145	624 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	NPTX1	Q15818	432 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	ARHGDIG	Q99819	225 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	TRIM2	Q9C040	744 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	C12orf10	Q9HB07	376 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	MALT1	Q9UDY8	824 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	LGI1	O95970	557 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	OR1Q1	Q15612	314 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	NRF1	Q16656	503 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	VMAC	Q2NL98	169 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	CASP12	Q6UXS9	341 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	ELOA3	Q8NG57	546 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	MRGBP	Q9NV56	204 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996		A0A0B4J2E0	115 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GX12	115 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	PDLIM1	O00151	329 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	AHSA1	O95433	338 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	ITGA5	P08648	1049 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	HSD17B8	Q92506	261 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	TAAR8	Q969N4	342 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	TMEM45B	Q96B21	275 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-222	ENST00000550996	PNMT	P11086	282 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	PTN	P21246	168 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	FAP	Q12884	760 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	MAPRE2	Q15555	327 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	STK11	Q15831	433 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	ACKR1	Q16570	336 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	MMEL1	Q495T6	779 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	ULK3	Q6PHR2	472 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	CCDC80	Q76M96	950 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	GPAT4	Q86UL3	456 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	SLC38A4	Q969I6	547 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	RCN3	Q96D15	328 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	ZNF583	Q96ND8	569 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	EDAR	Q9UNE0	448 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	MED13L	Q71F56	2210 aa		18.38	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996		A0A087WUJ7	227 aa		18.38	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	SLC22A2	O15244	555 aa		18.38	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	RAD51D	O75771	328 aa		18.38	■□□□□ 0.53
CS-222	ENST00000550996	LYPD3	O95274	346 aa		18.38	■□□□□ 0.53

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