RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 C16orf97H3BN30 126 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 M0R3G1 203 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 AQP7O14520 342 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ABCD4O14678 606 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 SIAH2O43255 324 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 FADS1O60427 444 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 CDC14BO60729 498 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 STX11O75558 287 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ZNF205O95201 554 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 SERPINB1P30740 379 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 COPZ1P61923 177 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ETFDHQ16134 617 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 FCRLAQ7L513 359 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ASB5Q8WWX0 329 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 GIMAP5Q96F15 307 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 TMEM19Q96HH6 336 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 VAPAQ9P0L0 249 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 DUSP13Q9UII6 198 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PPW3 197 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 NOTOA8MTQ0 251 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 A8MXE2 369 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ZNF195O14628 629 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 NCK1P16333 377 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CXCR1P25024 350 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 GSTM2P28161 218 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SRD5A2P31213 254 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 IDH3AP50213 366 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 KLF10Q13118 480 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CAMK2DQ13557 499 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 DEF8Q6ZN54 512 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SLC15A4Q8N697 577 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 OR52J3Q8NH60 311 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 LIPT1Q9Y234 373 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 J3QRK9 145 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 M0QX08 132 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CLIC1O00299 241 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 TNFSF13O75888 250 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 HLA-DOBP13765 273 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ASMTP46597 345 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CD300CQ08708 224 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ZNF846Q147U1 533 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CADM3Q8N126 398 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ZNF527Q8NB42 609 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 POC1BQ8TC44 478 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 TP53INP1Q96A56 240 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 OTULINQ96BN8 352 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 KLHL15Q96M94 604 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SERINC4A6NH21 518 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 AHRRA9YTQ3 701 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 HMGN4O00479 90 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SLC22A1O15245 554 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 F13BP05160 661 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CAPN3P20807 821 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 MAPK1P28482 360 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ACVR1BP36896 505 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 GFRA1P56159 465 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 GMFBP60983 142 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ITGADQ13349 1161 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 MELKQ14680 651 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 LAPTM4AQ15012 233 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 LRRC18Q8N456 261 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 OR8K3Q8NH51 312 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms