RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 REEP3Q6NUK4 255 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 SLC22A25Q6T423 547 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ELOA3Q8NG57 546 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 TMEM45BQ96B21 275 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZNF607Q96SK3 696 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.91□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 NF1P21359 2839 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 HIVEP2P31629 2446 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 AQP7P3A6NL99 342 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 SERPINB7O75635 380 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 BMP2P12643 396 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 BMP4P12644 408 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 PAX7P23759 505 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 SLC6A2P23975 617 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 MPGP29372 298 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ATP4BP51164 291 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZNF83P51522 516 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 AGKQ53H12 422 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 TMEM99Q8N816 258 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 MUS81Q96NY9 551 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 TRIM2Q9C040 744 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 FKRPQ9H9S5 495 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 RASD1Q9Y272 281 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.9□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TRIM64BA6NI03 449 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 M0R1B8 84 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 OR2T1O43869 369 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 EDNRAP25101 427 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 PRKAR1BP31321 381 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 PRPS1P60891 318 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 PPP2R2BQ00005 443 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CDK6Q00534 326 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 BNIP2Q12982 314 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 VEZF1Q14119 521 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 MAPK11Q15759 364 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SERPINA11Q86U17 422 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 MAL2Q969L2 176 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SMR3AQ99954 134 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 PLCE1Q9P212 2302 aa14.89□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 RAMP1O60894 148 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 LY6G6DO95868 133 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SOD3P08294 240 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 DANCRP0C864 163 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ARAFP10398 606 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 PNMTP11086 282 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 GABRA6Q16445 453 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 NRF1Q16656 503 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 RNF217Q8TC41 542 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 C3orf49Q96BT1 292 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 EBF4Q9BQW3 602 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 C12orf10Q9HB07 376 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.88□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 OVOL3O00110 214 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 FRS3O43559 492 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 NUDT7P0C024 238 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 PRG2P13727 222 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms