RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, human

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLSTN3-215	ENST00000544584	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	CCNA2	P20248	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	CD247	P20963	164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	PTAFR	P25105	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	MPG	P29372	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	MNAT1	P51948	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	FUT5	Q11128	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	PPA1	Q15181	289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	OR7A5	Q15622	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	NPTX1	Q15818	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	STK11	Q15831	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ETFDH	Q16134	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ACKR1	Q16570	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ZNF613	Q6PF04	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	TMEM72	A0PK05	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ZNF726	A6NNF4	738 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584		B4DXG7	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	MRAS	O14807	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	EFNA2	O43921	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	MGRN1	O60291	552 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	SLC43A1	O75387	559 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	LSP1	P33241	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	PCGF2	P35227	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	MVD	P53602	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	IST1	P53990	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	PRPS1	P60891	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	H3F3A	P84243	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	VEZF1	Q14119	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	POU4F3	Q15319	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLSTN3-215	ENST00000544584	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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