RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 EPXP11678 715 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 DCTDP32321 178 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 GNA13Q14344 377 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 CSRP2Q16527 193 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 C18orf63Q68DL7 685 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 CDC73Q6P1J9 531 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ZNF793Q6ZN11 406 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 NRROSQ86YC3 692 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 STK35Q8TDR2 534 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 COPZ2Q9P299 210 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 GPR34Q9UPC5 381 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 OR2M5A3KFT3 312 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 SELENOFO60613 162 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 F8A1P23610 371 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 FPR3P25089 353 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 TP53I3Q53FA7 332 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 OR7E24Q6IFN5 339 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 SYT13Q7L8C5 426 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 OSTF1Q92882 214 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 RGMAQ96B86 450 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 OR2M4Q96R27 311 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 OR14A2Q96R54 314 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 ARL6Q9H0F7 186 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 OR52D1Q9H346 318 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 STARD5Q9NSY2 213 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 LAMA5O15230 3695 aa8.39□□□□□ -1.07
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THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PPV9 198 aa8.39□□□□□ -1.07
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THBS3-211ENST00000541990 PLPP2O43688 288 aa8.39□□□□□ -1.07
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THBS3-211ENST00000541990 GALP22466 123 aa8.39□□□□□ -1.07
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THBS3-211ENST00000541990 H2BFSP57053 126 aa8.39□□□□□ -1.07
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THBS3-211ENST00000541990 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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THBS3-211ENST00000541990 WDR92Q96MX6 357 aa8.39□□□□□ -1.07
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THBS3-211ENST00000541990 MENTQ9BUN1 341 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 KLHL31Q9H511 634 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 PI4KAP42356 2102 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 DNAJB6O75190 326 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 TGM6O95932 706 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 PRG2P13727 222 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 GABRA1P14867 456 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 AKR1D1P51857 326 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 PDX1P52945 283 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 RAG2P55895 527 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-211ENST00000541990 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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