RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541456.1

PRR4-209, Transcript of proline rich 4, human

TSL 3

Gene PRR4, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-209	ENST00000541456	PMCH	P20382	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	IL12B	P29460	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	S100A5	P33763	92 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	CSK	P41240	450 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	ATP4B	P51164	291 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	PRKX	P51817	358 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	HSPA2	P54652	639 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	ATP12A	P54707	1039 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	UCN	P55089	124 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	UPP1	Q16831	310 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	UFD1	Q92890	307 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	RNF2	Q99496	336 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	THYN1	Q9P016	225 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-209	ENST00000541456	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456		H3BMQ9	156 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456		K7ERI5	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	OR7A10	O76100	309 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	MYO1D	O94832	1006 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	ERLIN2	O94905	339 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	AHSA1	O95433	338 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	IFNW1	P05000	195 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	FGF1	P05230	155 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	CT62	P0C5K7	136 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	HSD17B1	P14061	328 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	ABO	P16442	354 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	DPEP1	P16444	411 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	IGFBP5	P24593	272 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	SLC26A3	P40879	764 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	SLC1A2	P43004	574 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	PKNOX1	P55347	436 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	PEX3	P56589	373 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	SKP1	P63208	163 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	OR5I1	Q13606	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	VGLL4	Q14135	290 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	ZIC1	Q15915	447 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	DUSP7	Q16829	419 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	LIX1	Q8N485	282 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	ATP5S	Q99766	215 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-209	ENST00000541456	GBA3	Q9H227	469 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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