RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 COPZ1P61923 177 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSC22D1Q15714 1073 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 WBP2NLQ6ICG8 309 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDIT4LQ96D03 193 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM38AQ9H6F2 299 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARMC7Q9H6L4 198 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 GP6Q9HCN6 339 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM181Q9P2C4 612 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRSS50Q9UI38 385 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANK2Q01484 3957 aa17.02■□□□□ 0.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 OVOL3O00110 214 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF208O43345 1280 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 THBDP07204 575 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC6A2P23975 617 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 CXCR1P25024 350 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 MDH1P40925 334 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLK1P49759 484 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLF10Q13118 480 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTOV1Q86YD1 416 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSPEARQ8WU66 669 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 BEX2Q9BXY8 128 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC134Q9H6E4 229 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SAR1AQ9NR31 198 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM160Q9NX00 188 aa17.01■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF716A6NP11 495 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 WIPF1O43516 503 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP51A1Q16850 503 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZSWIM7Q19AV6 140 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 GABRG1Q8N1C3 465 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 C3orf49Q96BT1 292 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM204Q9BSN7 226 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRR14Q9BWN1 585 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACTR6Q9GZN1 396 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 LPAR3Q9UBY5 353 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRAPPC4Q9Y296 219 aa17■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 CR1P17927 2039 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF724A8MTY0 619 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADAP00813 363 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRKAR1BP31321 381 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 NTF4P34130 210 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR3A2P47893 321 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 CEACAM7Q14002 265 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR7A5Q15622 319 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALKBH2Q6NS38 261 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRT73Q86Y46 540 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 HIPK4Q8NE63 616 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 WFDC6Q9BQY6 131 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIF1Q9H611 641 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLAUP00749 431 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGHV3-9P01782 118 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 HTR2AP28223 471 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACVR1BP36896 505 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC35A1P78382 337 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 H3F3AP84243 136 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 RUNX1T1Q06455 604 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADAM5Q6NVV9 412 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 GALNT5Q7Z7M9 940 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMYD1Q8NB12 490 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 C11orf65Q8NCR3 313 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR10A6Q8NH74 314 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIGXQ8TBF5 258 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 C10orf82Q8WW14 230 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 S100PBPQ96BU1 408 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLPPR2Q96GM1 343 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF607Q96SK3 696 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 POTEKPQ9BYX7 375 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 FANCFQ9NPI8 374 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANGPT4Q9Y264 503 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR52Q9Y2T5 361 aa16.98■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 LIPT2A6NK58 231 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNPH1O43598 174 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRT34O76011 436 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 AKR7A3O95154 331 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 OPN1SWP03999 348 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP2K6P52564 334 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDK3Q15120 406 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 MMEL1Q495T6 779 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SFRP5Q5T4F7 317 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 REP15Q6BDI9 236 aa16.97■□□□□ 0.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 NANOGP8Q6NSW7 305 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms