RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 S100A12P80511 92 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 EFNB1P98172 346 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 MED22Q15528 200 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 VWA2Q5GFL6 755 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 PMS2CLQ68D20 193 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 CARFQ8N187 725 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 PFN4Q8NHR9 129 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 TMEM239Q8WW34 195 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 MVB12AQ96EY5 273 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 WBP1Q96G27 269 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 RBP7Q96R05 134 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 LMF1Q96S06 567 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 NPAS1Q99742 590 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 DPH1Q9BZG8 443 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 SERTAD3Q9UJW9 196 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 CMAHPQ9Y471 501 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 FMO6PO60774 539 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 LYPD3O95274 346 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 TSPAN19P0C672 248 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 CKMT1AP12532 417 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 MXD1Q05195 221 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 IKZF1Q13422 519 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ANGPT1Q15389 498 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 FCN2Q15485 313 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 KLHL12Q53G59 568 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 GUSBP11Q6P575 273 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 CORO6Q6QEF8 472 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 SLC34A3Q8N130 599 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 BCORP1Q8N888 145 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 OSTF1Q92882 214 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 CRELD1Q96HD1 420 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 CBLCQ9ULV8 474 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 A0A0A6YYJ9 748 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 A0A1B0GTQ1 180 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 A0A1B0GWA3 101 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 SMIM30A4D0T7 59 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 FABP12A6NFH5 140 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 H0YC42 278 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 LGALS8O00214 317 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 APOL3O95236 402 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 CLPSP04118 112 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 HRGP04196 525 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 MAKP20794 623 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 EFNA3P52797 238 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ATP12AP54707 1039 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 DSG2Q14126 1118 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 HLA-BQ31612 363 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 HSDL2Q6YN16 418 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ATCAYQ86WG3 371 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 TMEM163Q8TC26 289 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 FGF11Q92914 225 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 SAMD8Q96LT4 415 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 OR1F2PQ96R84 312 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 MGLLQ99685 303 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ZNF559Q9BR84 538 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 MALT1Q9UDY8 824 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 PRODH2Q9UF12 536 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 NPIPB9F8W1W9 429 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 TEX46H3BTG2 121 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX6-210ENST00000528252 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms