RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 KITP10721 976 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ETFAP13804 333 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 GPAT4Q86UL3 456 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ELOA3Q8NG57 546 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 FAM168AQ92567 244 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 KLF11O14901 512 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 WNT11O96014 354 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 IFNA2P01563 188 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 BCHEP06276 602 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TFPTP0C1Z6 253 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 BMP4P12644 408 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 PRG2P13727 222 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A16P16260 332 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CRATP43155 626 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 COPZ1P61923 177 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CHRNB3Q05901 458 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 LIN52Q52LA3 116 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 NXNQ6DKJ4 435 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TMEM225Q6GV28 225 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 THAP1Q9NVV9 213 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CALML5Q9NZT1 146 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 MOKQ9UQ07 419 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ATRQ13535 2644 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 COL6A5A8TX70 2615 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 RNF212BA8MTL3 300 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 A8MVM7 634 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A3O75751 556 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 KRT33AO76009 404 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 LY6HO94772 140 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ANP32DO95626 131 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 IL6P05231 212 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 IDO1P14902 403 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 EFNA4P52798 201 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CRISP3P54108 245 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 DSTNP60981 165 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 GTDC1Q4AE62 458 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 MGARPQ8TDB4 240 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 FBXO17Q96EF6 278 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 PIF1Q9H611 641 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TMEM120BA0PK00 339 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 FRS3O43559 492 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 LGI1O95970 557 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 SELENOPP49908 381 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 P2RY4P51582 365 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 VLDLRP98155 873 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 LGALS3BPQ08380 585 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 RNF220Q5VTB9 566 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 CROCCP2Q86T23 111 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 RAB21Q9UL25 225 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 VAMP5O95183 116 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 MST1LQ2TV78 715 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 SERPINA11Q86U17 422 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-211ENST00000513325 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms