RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	C1orf50	Q9BV19	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ATR	Q13535	2644 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CAD	P27708	2225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GJE1	A6NN92	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC28A1	O00337	649 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	AZIN1	O14977	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CYTIP	O60759	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TBX19	O60806	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	C6orf47	O95873	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CHRNG	P07510	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ITGA5	P08648	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	LAMP1	P11279	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	UBL4A	P11441	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	BCKDHA	P12694	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GGT1	P19440	569 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	IGFBP5	P24593	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TTK	P33981	857 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SOAT1	P35610	550 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	VLDLR	P98155	873 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SKP2	Q13309	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PTGR1	Q14914	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR7D2	Q96RA2	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	STAC	Q99469	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	FOXB1	Q99853	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PIGU	Q9H490	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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