RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF527Q8NB42 609 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR4C3Q8NH37 302 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR8K3Q8NH51 312 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NUBPLQ8TB37 319 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TSLPQ969D9 159 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 RFKQ969G6 155 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 C3orf49Q96BT1 292 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 BPIFA2Q96DR5 249 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LGALS12Q96DT0 336 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LOXL4Q96JB6 756 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LRR1Q96L50 414 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF649Q9BS31 505 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NUDT9Q9BW91 350 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MND1Q9BWT6 205 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LAT2Q9GZY6 243 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR52D1Q9H346 318 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 UBQLN3Q9H347 655 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DSN1Q9H410 356 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 HHATLQ9HCP6 504 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DLL4Q9NR61 685 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CMC2Q9NRP2 79 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SELENONQ9NZV5 590 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CNIH4Q9P003 139 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 KNL1Q8NG31 2342 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR2W5A6NFC9 320 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 EFCAB9A8MZ26 197 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 D6RAR5 112 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CCRL2O00421 344 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IMPA2O14732 288 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ARPC3O15145 178 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IDH3BO43837 385 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PIP5K1CO60331 668 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FADS1O60427 444 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NTN1O95631 604 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 RAB36O95755 333 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CSTAP01040 98 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CELA3BP08861 270 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PF4V1P10720 104 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PNMTP11086 282 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 UBL4AP11441 157 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PEPDP12955 493 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IFI30P13284 250 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SLC2A5P22732 501 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GPR4P46093 362 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CAPZA2P47755 286 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MTNR1AP48039 350 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PGDP52209 483 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PNLIPRP2P54317 469 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LGALS4P56470 323 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IL13RA1P78552 427 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CCL7P80098 99 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 BDH1Q02338 343 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TPBGQ13641 420 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IL11RAQ14626 422 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SPHARQ15513 63 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NSDHLQ15738 373 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SSX1Q16384 188 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 VWA2Q5GFL6 755 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SMARCD3Q6STE5 483 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms