RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ARL5B	Q96KC2	179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	PSD2	Q9BQI7	771 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	OR10A4	Q9H209	315 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	LIME1	Q9H400	295 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	PIF1	Q9H611	641 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	DNHD1	Q96M86	4753 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	MTOR	P42345	2549 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM72	A0PK05	275 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	PDLIM1	O00151	329 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	SEC14L5	O43304	696 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	FMO6P	O60774	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	PRKD3	O94806	890 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ANP32D	O95626	131 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	OPN1SW	P03999	348 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	YES1	P07947	543 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	TSPAN19	P0C672	248 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	GKN3P	P0CG01	181 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	COX6B1	P14854	86 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	FST	P19883	344 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	TNFRSF1B	P20333	461 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	CD247	P20963	164 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ENPP1	P22413	925 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ME2	P23368	584 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	TACR3	P29371	465 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	LSP1	P33241	339 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	PCGF2	P35227	344 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	CD79B	P40259	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	KCNJ5	P48544	419 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	DIO1	P49895	249 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	MERTK	Q12866	999 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	MYBPH	Q13203	477 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	SCARB2	Q14108	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	SLC17A1	Q14916	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	NRF1	Q16656	503 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	DUSP7	Q16829	419 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	VMAC	Q2NL98	169 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	LIN52	Q52LA3	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	HBM	Q6B0K9	141 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	FCRLA	Q7L513	359 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF550	Q7Z398	422 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	KIF18B	Q86Y91	864 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	HIPK4	Q8NE63	616 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	OR6S1	Q8NH40	331 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	SLC38A4	Q969I6	547 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	LURAP1	Q96LR2	239 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	DACH2	Q96NX9	599 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ARHGDIG	Q99819	225 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	FANCF	Q9NPI8	374 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	GALNT8	Q9NY28	637 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CUX1-208	ENST00000485792	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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