RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484581.6

VPS13A-211, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-211ENST00000484581 STYXL1Q9Y6J8 313 aa3.51□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa3.51□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 DHRS7CA6NNS2 312 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 HIP1O00291 1037 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 UGT1A9O60656 530 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 OR2J3O76001 311 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 C1orf105O95561 183 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 NPR2P20594 1047 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 RRM2P31350 389 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 MAGEA9P43362 315 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 CDKN1BP46527 198 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 CLDN8P56748 225 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 PAX2Q02962 417 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 SERTAD2Q14140 314 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 DOC2AQ14183 400 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 TGFBIQ15582 683 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 GPRC6AQ5T6X5 926 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 GDPD3Q7L5L3 318 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 VRK2Q86Y07 508 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 HIPK1Q86Z02 1210 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 NRGNQ92686 78 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 OXGR1Q96P68 337 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 NMUR2Q9GZQ4 415 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 GNB4Q9HAV0 340 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa3.5□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 HCFC1P51610 2035 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 GOLGA8TH3BQL2 631 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 DCTN6O00399 190 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 DLGAP1O14490 977 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 CLOCKO15516 846 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 AKR7A2O43488 359 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 TOM1O60784 492 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 CCNB1P14635 433 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 IL2RGP31785 369 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 NAMPTP43490 491 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 RPS5P46782 204 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 RAB10P61026 200 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 RUNX3Q13761 415 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 QRICH1Q2TAL8 776 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 KLHL40Q2TBA0 621 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 SASS6Q6UVJ0 657 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 NRMQ8IXM6 262 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 GPR65Q8IYL9 337 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 OR5M11Q96RB7 305 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 SRXN1Q9BYN0 137 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 RACGAP1Q9H0H5 632 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 INSRP06213 1382 aa3.49□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 A0A0J9YWU9 116 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 GPAA1O43292 621 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 STAMBPO95630 424 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 SLC35E2P0CK97 266 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 RNF224P0DH78 156 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 IGLL1P15814 213 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF24P17028 368 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 VDAC1P21796 283 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 HSD17B2P37059 387 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 SLC11A1P49279 550 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 MS4A2Q01362 244 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 TLE4Q04727 773 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 CD47Q08722 323 aa3.48□□□□□ -1.85
VPS13A-211ENST00000484581 CCDC173Q0VFZ6 552 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms