RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 USP51Q70EK9 711 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SETD6Q8TBK2 473 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 NEUROG1Q92886 237 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 C3orf49Q96BT1 292 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GPR78Q96P69 363 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ADOQ96SZ5 270 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 NPAS1Q99742 590 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PROCRQ9UNN8 238 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.96□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 VWC2LB2RUY7 222 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 J3QRK9 145 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 M0QZ24 198 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ANGPT2O15123 496 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GMFGO60234 142 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GABARAPO95166 117 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 YES1P07947 543 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CT45A8P0DMV1 189 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CT45A9P0DMV2 189 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 UMPSP11172 480 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ENPP1P22413 925 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 EPHA3P29320 983 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ALDH9A1P49189 494 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ETV1P50549 477 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 BLVRAP53004 296 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MAPK12P53778 367 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PON3Q15166 354 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ESCO2Q56NI9 601 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CEP78Q5JTW2 689 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RAET1LQ5VY80 246 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 LIPJQ5W064 366 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GGNQ86UU5 652 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 METTL4Q8N3J2 472 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MFSD4AQ8N468 514 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 HIPK4Q8NE63 616 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 OR2M3Q8NG83 312 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SLC35A4Q96G79 324 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 VSTM2LQ96N03 204 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF681Q96N22 645 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 COL21A1Q96P44 957 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CIB1Q99828 191 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 APOL4Q9BPW4 351 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 EBF4Q9BQW3 602 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PINK1Q9BXM7 581 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RNF122Q9H9V4 155 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PCTPQ9UKL6 214 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 USP22Q9UPT9 525 aa6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms