RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 C1RP00736 705 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 TRBC1P01850 177 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 EPXP11678 715 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 FABP4P15090 132 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 MAKP20794 623 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 CD1BP29016 333 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 ARL4AP40617 200 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 AVPR1BP47901 424 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 DGKGP49619 791 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 AKR1C2P52895 323 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 CRISP3P54108 245 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 CLDN8P56748 225 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 UBE2G2P60604 165 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 AKR1C1Q04828 323 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF345Q14585 488 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 HERPUD1Q15011 391 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 PLK5Q496M5 336 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 C22orf42Q6IC83 251 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 VRK2Q86Y07 508 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2M7Q8NG81 312 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 MCEEQ96PE7 176 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 DIRC2Q96SL1 478 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 EPYCQ99645 322 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 AMBNQ9NP70 447 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PPH5 198 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PR64 198 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PRV1 198 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SMIM22K7EJ46 135 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 K7ERU9 68 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 IRAK2O43187 625 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFS3O75489 264 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC25A12O75746 678 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 VAMP5O95183 116 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 VNN2O95498 520 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 JCHAINP01591 159 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 HPXP02790 462 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 RLN1P04808 185 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 BCHEP06276 602 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 CKMP06732 381 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 C1SP09871 688 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SBK3P0C264 359 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SFTA3P0C7M3 94 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 CD79AP11912 226 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 HGFP14210 728 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 CPEP16870 476 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 GLRA1P23415 457 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 PBX2P40425 430 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 DGKEP52429 567 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 NRG3P56975 720 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 TFF2Q03403 129 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 TAF9Q16594 264 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 ODF4Q2M2E3 257 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 RAB6CQ53S08 254 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF534Q76KX8 674 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 CD200R1Q8TD46 325 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms