RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC31Q6UY01 552 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF677Q86XU0 584 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 FTMTQ8N4E7 242 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA4Q8NEY3 305 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 MRAPQ8TCY5 172 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PAGE5Q96GU1 130 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OXGR1Q96P68 337 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNA7Q96RP8 456 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF702PQ9H963 129 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 STAP1Q9ULZ2 295 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OR5B21A6NL26 309 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 GAS8-AS1O95177 125 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 MMP1P03956 469 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TNNI1P19237 187 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 GALP22466 123 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC26A2P50443 739 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS8P62241 208 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TGM3Q08188 693 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PARP15Q460N3 678 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 BCL7AQ4VC05 210 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 XKR7Q5GH72 579 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4K14Q8NGD5 310 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 NEIL2Q969S2 332 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TM4SF19Q96DZ7 209 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SMIM14Q96QK8 99 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CNPY3Q9BT09 278 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0G2JRQ6 117 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TCP11X1B4DZS4 312 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ABCD4O14678 606 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF13O43567 381 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TOM1O60784 492 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OR7A10O76100 309 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 LGI1O95970 557 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHV3-48P01763 117 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KITLGP21583 273 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CHMLP26374 656 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP5OP48047 213 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNJ2P63252 427 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TLE4Q04727 773 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PPIL2Q13356 520 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA0040Q15053 153 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 RAET1LQ5VY80 246 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC66Q68CR7 880 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 VRK2Q86Y07 508 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 RDH10Q8IZV5 341 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4F6Q8NGB9 312 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 FGF11Q92914 225 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 EHD1Q9H4M9 534 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 VNN3Q9NY84 501 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 Q9UF83 564 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 STARD10Q9Y365 291 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 V9GY05 133 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 MBTPS2O43462 519 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PSTPIP1O43586 416 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT6AP02538 564 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 P04436 131 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SERPIND1P05546 499 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 VHLP40337 213 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 BTDP43251 543 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OR3A4PP47883 348 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KLK7P49862 253 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 RIPPLY3P57055 190 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SPANXN2Q5MJ10 180 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms