RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467956.1

CLASP2-208, Transcript of cytoplasmic linker associated protein 2, human

TSL 2

Gene CLASP2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLASP2-208	ENST00000467956	ARAF	P10398	606 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	SLC6A2	P23975	617 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	IGFBP5	P24593	272 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	CXCR1	P25024	350 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	SLC1A3	P43003	542 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	CDK6	Q00534	326 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	SPOCK1	Q08629	439 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	EPS8	Q12929	822 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	MAPRE2	Q15555	327 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	RNF220	Q5VTB9	566 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	REEP3	Q6NUK4	255 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	BEND4	Q6ZU67	534 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	ZNF524	Q96C55	264 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	DDIT4L	Q96D03	193 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	ZNF607	Q96SK3	696 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CLASP2-208	ENST00000467956	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36	2e-10	■■■■■ 39.2
CLASP2-208	ENST00000467956	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	SLC35F4	A4IF30	521 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	FES	P07332	822 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	CD3E	P07766	207 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	GKN3P	P0CG01	181 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	BMP2	P12643	396 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	ETS2	P15036	469 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	TACR3	P29371	465 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	DIO1	P49895	249 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	OR2B6	P58173	313 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	NCALD	P61601	193 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	VLDLR	P98155	873 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	SCARB2	Q14108	478 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	MAPK11	Q15759	364 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	ZNF525	Q8N782	197 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	CGREF1	Q99674	301 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	FAAH	O00519	579 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	SERPINB7	O75635	380 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	YES1	P07947	543 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	AQP1	P29972	269 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	MTPN	P58546	118 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	PLAUR	Q03405	335 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	DPP10	Q8N608	796 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	HIPK4	Q8NE63	616 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	KCNK17	Q96T54	332 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	GP6	Q9HCN6	339 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	TMEM160	Q9NX00	188 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	EMC3	Q9P0I2	261 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	LY6H	O94772	140 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	GPX2	P18283	190 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	MAP2K6	P52564	334 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	P2RY6	Q15077	328 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	SERPINA11	Q86U17	422 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	RETREG3	Q86VR2	466 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	RNF217	Q8TC41	542 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	SH3GL1	Q99961	368 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CLASP2-208	ENST00000467956	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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